IAES se ha posicionado principalmente como una institución otorgadora de financiamientos.  Un fondo en fideicomiso nacional como FIAES posee una variedad de roles para desempeñar y procesos por adoptar, limitados únicamente por su mandato legal, los lineamientos de su Consejo Administrativo y administración superior y el amplio ambiente en el cual opera.

FIAES otorga financiamientos para proyectos sobre la base de un proceso competitivo de propuestas.  Los aplicantes tienen la libertad de escoger entre las áreas tan vastas de eligibilidad definidas en los convenios varios y los reglamentos establecidos.  FIAES monitorea de cerca los aportes y la información producida a través de visitas de campo trimestrales para determinar los avances que se han llevado a cabo con los proyectos. 

FIAES y el MARN (Ministerio de Medio Ambiente y Recursos Naturales), como rector del medio ambiente, trabajan de manera coordinada y tienen una relación especial. Los proyectos ambientales financiados por FIAES deben tomar en consideración las prioridades y áreas identificadas en la Estrategia Nacional de Medio Ambiente y la Estrategia para la Biodiversidad. Asimismo, si un proyecto incluye actividades relacionadas con áreas naturales, microcuencas, mangle o manejo de desechos sólidos, es requisito una aprobación del MARN.  FIAES ha trabajado tesoneramente para mantener su independencia como una institución de la sociedad civil salvadoreña, mientras al mismo tiempo se asegura que los proyectos financiados sean del interés de las prioridades nacionales.

El proceso de propuestas de FIAES es competitivo, ya que FIAES ha establecido un proceso claro, transparente, pero relativamente restrictivo para determinar eligibilidad para el otorgamiento de fondos. Mientras los criterios son respetados en la comunidad de ONG y ADESCO, se establece una mayor posibilidad para acceder a la palestra de financiamiento. Para que una organización solicitante pueda calificar y obtener fondos de FIAES, debe (1) ser una organización legalmente constituida, (2) poseer un registro exitoso de proyectos ejecutados y sin señalamientos negativos de Auditoría, y (3) ser capaz de financiarse por su cuenta los costos de los $25 la cuota por aplicación, preparar y entregar el papeleo para la etapa de perfil y si tiene de ser exitoso, la propuesta completa.  Como parte de la competencia anual de proyectos, FIAES ofrece un taller inicial para las organizaciones que requirieron paquetes de aplicación y están considerando el preparar un perfil, y un taller posterior par ayudar a las organizaciones exitosas en la etapa de perfil para preparar una propuesta sólida, pero no ofrece ningún financiamiento para costear ningún costo de la preparación o el diseño del perfil o la propuesta en sí. 

La Ley de Areas Naturales Protegidas aprobada en febrero de 2005 permite la creación de fondos en fideicomisos u otros programas financiadores con fondos públicos o privados, específicamente para el manejo del Sistema de Areas Protegidas. La Ley establece que los fondos pueden ser generados por cuotas de entrada, donaciones, contribuciones voluntarias, pago por servicios ambientales, ventas o publicaciones, y otras fuentes. FIAES posee una reputación reconocida por su apoyo exitoso a proyectos en Areas Protegidas y estaría en una buena posición para competir por el manejo de cualquier fondo en fideicomiso que fuera creado bajo esta estipulación. FIAES tendría que competir sobre la base de su transparencia, independencia y status único como una institución de la sociedad civil salvadoreña.